位于大阪的鸨屋蛟龙堂最早以药材批发起家之后凭借秘方配制的药丸逐渐闻名远近及至第二代两名弟子互不服输导致蛟龙堂分裂两家当街对门经营各以“元祖”和“本家”自居暗斗多年两年前本家第三代当家善池喜一郎(遠藤要 饰)与元祖当家丸部长彦(忍成修吾 饰)发生争执并用硫酸将对方毁容悲剧过后长彦头戴面具深锁阁楼喜一郎则不知去向某日喜一郎的妹妹初惠(武井咲 饰)请来青年侦探金田一耕助(山下智久 饰)调查本家员工被跟踪的事件后者却目睹长彦遭绑架并遇害的惊人一幕绵亘两代的纷争仍在继续金田一不得不努力揭开隐藏多年的谜题而早已功成名就的名侦探明智小五郎(伊藤英明 饰)也化身记者与金田一展开一场侦探的对决…… 本片根据芦边拓的原作改编